Факультет управления КУБГАУ начал свою историю в 2001 году. Это один из самых молодых и активно развивающихся факультетов. 80% преподавательского состава - практики и теоретики с учёными степенями и званиями, а для подкрепления навыков привлекаются действующие государственные и муниципальные служащие, руководители и работники коммерческих организаций. На факультете работает «Бизнес-школа Кубанского ГАУ», где топ-менеджеры крупнейших международных компаний делятся опытом управления бизнесом.